I Separatisti erano sotto il controllo del Conte Dooku, che era sotto il controllo di Sidious, che essenzialmente stava conducendo l'intera Guerra dei Cloni e usandola come scusa per conquistare la Repubblica e trasformarla in un impero. Quindi, quando la Guerra dei Cloni è finita e Sidious ha il controllo di tutto, potrebbe facilmente ottenere i droidi da battaglia usati dai Separatisti senza troppi problemi e un minimo di spesa.
Anche se posso capire perché uno non vorrebbe un esercito di droidi al 100%, avrebbe senso usare i droidi quando possibile, dal momento che non hanno bisogno di cibo (basta collegarli), le parti sono intercambiabili e sono ancora più usa e getta dei clonetrooper.
Allora perché l'Impero non li usa quando possibile al posto degli stormtrooper? C'è una ragione nell'universo per cui la Deathstar non trasporta truppe clone o perché un mondo arretrato come Tatooine non è lasciato principalmente a soldati droidi invece che assaltatori umani?
Nota che sto parlando nell'universo, ma dal momento che Lucas aveva presumibilmente mappato la trilogia del prequel prima di finire di scrivere Episodio IV , avrebbe comunque potuto usare gli umani in costumi da droide se avesse ritenuto di poterlo fare realisticamente (come con C-3P0) invece di usare le uniformi degli Stormtrooper. In altre parole, se Lucas stesse già pensando a un utilizzo così diffuso dei droidi nelle prime fasi, avrebbe potuto utilizzarlo in Episodio IV .